Die programmatische Arbeit der AfD Thüringen wird durch die Programmkommission unterstützt.

Die Programmkommission bereitet die programmatischen Anträge auf, stimmt sie aufeinander ab und erstellt nach Zustimmung durch den Landesvorstand eine Beschlussvorlage für den Landesparteitag. Die Programmkommission berät alle programmatischen Anträge und gibt dem Landesparteitag Empfehlungen für ihre Behandlung. Im Vorfeld eines Landesparteitags holt sie ein Mitgliedervotum ein, in dem alle Mitglieder die Möglichkeit haben, Anträge zu kommentieren und im Sinne eines Stimmungsbildes zu bewerten.